Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI3Q9ULW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
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