Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW6

NAP1L2, Nucleosome assembly protein 1-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L2Q9ULW6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NAP1L2Q9ULW6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L2Q9ULW6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms