Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABT1Q9ULW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABT1Q9ULW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms