Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2AQ9ULE3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms