Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO4Q9UKT5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms