Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms