Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF180Q9UJW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF180Q9UJW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms