Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF11Q9UIL8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms