Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPN3Q9UHW5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPN3Q9UHW5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms