Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MLH3Q9UHC1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MLH3Q9UHC1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MLH3Q9UHC1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms