Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms