Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB4Q9UDY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms