Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms