Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ORC3Q9UBD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ORC3Q9UBD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms