Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCL2Q9UBD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms