Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms