Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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