Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms