Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms