Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms