Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms