Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms