Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VNN3Q9NY84 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms