Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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