Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX43Q9NXZ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms