Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms