Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms