Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK13-1Q9NX77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms