Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms