Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DCAF13Q9NV06 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms