Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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