Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF3Q9NUQ8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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