Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PDS5BQ9NTI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PDS5BQ9NTI5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms