Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL17Q9NRX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL17Q9NRX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms