Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK2Q9NRA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms