Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms