Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF3Q9NR23 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms