Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms