Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms