Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED4Q9NPJ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms