Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTA1Q9NP79 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTA1Q9NP79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VTA1Q9NP79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms