Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms