Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms