Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRPEL1Q9HAV7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRPEL1Q9HAV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRPEL1Q9HAV7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms