Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF408Q9H9D4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms