Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf49Q9H6J7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms