Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STN1Q9H668 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms