Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms