Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN2Q9H4D0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN2Q9H4D0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms