Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F5

RNF38, E3 ubiquitin-protein ligase RNF38, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF38Q9H0F5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF38Q9H0F5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF38Q9H0F5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms